无论进水的条件是否合乎反渗透的要求，当膜元件的产水量下降达10%，产水的电导率升高，或系统压差增加15%时，适当的化学清洗便需要进行。

清洗条件：

注：每清洗时，每支膜的压差不应超过12PSI(0.83KG)或每支压力容器应该不高于50PSI(3.4KG)的压差。

长期保存消毒方法：

当反渗透系统需要长期停机超过3天，系统里的膜元件便需要作适当的保存程序。一般停机超过3-5天，可以用1%的亚硫酸氢钠溶液来保存。如需停机超过一星期以上，便要考虑用福尔马林来进行保存了。

保存的程序：

在停机之前，首先用化学清洗，保证膜元件完全清洁，然后再进行以下保存消毒。

1用系统容量三倍的预处理水来冲洗。

2在预定的化学桶内，加入亚硫酸氢钠固体和适量的软水，制配1%浓度的亚硫酸氢钠溶液（溶液的溶量要按系统的总溶量算定）。

3用泵将溶液循环30分钟，排掉首先出来20%的溶液。

4排掉在化学桶内多余的溶液，但保留系统内的消毒液体直至再开机为止。

注：在从新开机时，必须将所有的液体冲掉。冲洗时间最少需要1-2个小时。

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